Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C18orf8Q96DM3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C18orf8Q96DM3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C18orf8Q96DM3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms