Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAF2Q96CS3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms