Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SCAMP4Q969E2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCAMP4Q969E2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms