Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TNFRSF25Q93038 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNFRSF25Q93038 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms