Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNPO1Q92973 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms