Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC1Q92574 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC1Q92574 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms