Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RUFY2Q8WXA3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RUFY2Q8WXA3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RUFY2Q8WXA3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms