Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LMO7Q8WWI1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LMO7Q8WWI1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LMO7Q8WWI1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.3 ms