Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SKA2Q8WVK7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SKA2Q8WVK7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms