Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC7Q8WUI4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms