Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2AF1L4Q8WU68 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
U2AF1L4Q8WU68 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms