Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX29Q8TEQ0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX29Q8TEQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.9 ms