Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF397Q8NF99 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF397Q8NF99 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms