Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CARMIL3Q8ND23 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CARMIL3Q8ND23 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms