Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCY6

MSANTD4, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD4Q8NCY6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MSANTD4Q8NCY6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSANTD4Q8NCY6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms