Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KDM1BQ8NB78 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KDM1BQ8NB78 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms