Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
USP38Q8NB14 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP38Q8NB14 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP38Q8NB14 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms