Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATG16L2Q8NAA4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ATG16L2Q8NAA4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms