Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MFSD2AQ8NA29 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms