Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD53Q8N9V6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD53Q8N9V6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD53Q8N9V6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD53Q8N9V6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ANKRD53Q8N9V6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD53Q8N9V6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ANKRD53Q8N9V6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ANKRD53Q8N9V6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms