Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NECAB1Q8N987 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NECAB1Q8N987 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms