Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HACE1Q8IYU2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms