Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
WDR49Q8IV35 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
WDR49Q8IV35 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms