Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD5

LDLRAD3, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD3Q86YD5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAD3Q86YD5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAD3Q86YD5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms