Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC11Q7Z392 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC11Q7Z392 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms