Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTOP3Q7RTS5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
OTOP3Q7RTS5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 264.2 ms