Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYDE1Q6ZW31 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYDE1Q6ZW31 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms