Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ0

RNF19B, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19BQ6ZMZ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF19BQ6ZMZ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF19BQ6ZMZ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms