Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LBX2Q6XYB7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LBX2Q6XYB7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms