Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NSMFQ6X4W1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NSMFQ6X4W1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NSMFQ6X4W1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms