Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VSTM1Q6UX27 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VSTM1Q6UX27 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms