Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNT2Q6UVM3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNT2Q6UVM3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT2Q6UVM3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT2Q6UVM3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT2Q6UVM3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT2Q6UVM3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT2Q6UVM3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT2Q6UVM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNT2Q6UVM3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms