Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZCCHC12Q6PEW1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZCCHC12Q6PEW1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms