Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT4

SLC30A6, Zinc transporter 6, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A6Q6NXT4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC30A6Q6NXT4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC30A6Q6NXT4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms