Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
APOBEC3HQ6NTF7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3HQ6NTF7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms