Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCN10Q6JVE6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LCN10Q6JVE6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms