Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RCSD1Q6JBY9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RCSD1Q6JBY9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms