Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ANKRD40Q6AI12 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ANKRD40Q6AI12 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ANKRD40Q6AI12 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms