Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USPL1Q5W0Q7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USPL1Q5W0Q7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USPL1Q5W0Q7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms