Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B1

RNF219, RING finger protein 219, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF219Q5W0B1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF219Q5W0B1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF219Q5W0B1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms