Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TAF3Q5VWG9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TAF3Q5VWG9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms