Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01545Q5VT33 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC01545Q5VT33 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms