Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RIF1Q5UIP0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RIF1Q5UIP0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RIF1Q5UIP0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms