Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF648Q5T619 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.33■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF648Q5T619 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms