Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO47Q5MNV8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO47Q5MNV8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms