Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PITRM1Q5JRX3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PITRM1Q5JRX3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms