Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MS4A13Q5J8X5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A13Q5J8X5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms