Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CAVIN4Q5BKX8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CAVIN4Q5BKX8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms