Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PAN3Q58A45 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAN3Q58A45 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms