Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00303Q3SY05 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00303Q3SY05 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms